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宇宙依旧在默默的运行着，如同永恒……在血瞳迷茫的这段时间里，克罗迪尔的文明快速发展。
围绕着原始胚胎，他们发展出一条新的生物科技路线。战侍和原始的专属战士开始出现在克罗迪尔对外征服的舞台中。而殖装也获得巨大改变，开始摆脱原始芯核的结构，发展出一种介于能量和生物之间的新核心。大型生物兵器‘冢体‘和寄生细胞集群‘种体’开始出现。
这一阶段的克罗迪尔人是近乎无敌的，凭借着与众不同的生物文明，他们在宇宙中打下了偌大的疆域。任何文明，不管是机械文明还是能量文明，都无法阻挡他们征服的脚步。一个个星域被占领，一个个文明被征服。克罗迪尔文明如瘟疫般蔓延，迅速侵占了大片的星空。
扩张，再扩张。
一代代的征服者永不停止，而在战侍和专属战士的支持下，克罗迪尔人摆脱了人手不足的缺陷，从而爆发出恐怖的侵略性。
他们通过征服来掠夺资源，同时将被征服的文明纳入体系。形成了一个类似金字塔形态的等级社会。克罗迪尔人是这个社会的第一群体，而其他种族则按照克罗迪尔人的需求一一排列。其中，一些强力种族被克罗迪尔人专门提取出来进行了广域调制。从而成为专属战士的后备梯队。
他们称这些强力种族的原始家乡为……
‘战士之眠’。
这一阶段克罗迪尔的战争模式初步成型，形成了以征服者为主体，下辖战侍和专属战士的侵略单位。无尽的战斗促进了克罗迪尔人的进化，渐渐的主宰者出现了。他们人数极少，却拥有强大到令人绝望的战斗力。成为克罗迪尔文明的新星。
当然和另一个人相比，主宰者的出现就不那么耀眼了。
他的名字叫做‘希尔斯’，是一名智者。
他用了一百七十二年的时间破解了原始胚胎的基因密码，从而发现了一个隐藏极深的秘密。
那就是克罗迪尔人的缺陷并非来自基因本身，而是来自一种神秘的存在。充满了灵能的意味。灵能又属于神秘学的范畴，所以简单来说的话也可以形容为灵魂。克罗迪尔人，早在灵魂阶段就被埋下了厄运的种子。
人造生命是没有灵魂的，因为那是神的领域。但克罗迪尔人却有，这又再次打破了常识。
这个发现极为重要，第一次确认了克罗迪尔人噩梦的起源。也引起了第二代王的关注。他为此调集了整个文明三分之一的智者，试图破解这一切。可结果却让所有人失望。灵魂学本就是神秘学中的一部分，而神秘学又是宇宙公认最玄妙。最没有道理的学科。指望用常规手段破解克罗迪尔人灵魂的秘密无异于天方夜谭。
七千八百名智者用去了近百年时间也无法找到一丝线索。最终几近绝望。
可就在这时，事情有了转机。
外出的征服者发现了一个新文明。这是一个奇特的文明，它的名字叫做‘马尔克’。
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